Lab + Clincal | PCR vs NGS，肿瘤基因检测的现在和未来？

PCR和NGS两个平台在操作流程、报告周期、检测技术等方面各有千秋，在肿瘤基因检测过程中发挥着不同的作用，今天分别就操作流程、报告周期、检测技术三个方面进行详细的分析，评估PCR和NGS两个方法学的优劣势。

操作流程：对于PCR来讲，其操作流程只需要三步，即：“核酸提取”、“上机”、“结果判读”，操作流程相对较短且实验操作比较容易，对实验人员的熟练度要求较低，不需要专业的生物信息学分析人员和报告注释人员。而对于NGS来讲，则需要较长的操作流程，如“核酸提取”、“预文库构建”、“终文库构建”、“测序”、“生物信息学分析”及报告注释等六个流程，流程相对复杂且实验操作比较繁琐，对实验人员的熟练度要求比较高，且需要专业的生物信息学分析人员和报告注释人员。

报告周期：操作流程的多少和难易也直接影响了检测的报告周期，通常情况下PCR检测的报告周期在3-4天(着急情况下一天就可以出具报告);而NGS的报告周期则要6-8天(需要要凑样本上机)，报告周期有着明显的差异，如果在后续实验过程中出现问题(比如所建库失败、下机数据不合格等)则会更加扩大报告周期的差异。长报告周期可能会导致住院患者增加住院费用、跨城就诊的门诊患者增加来回通勤的时间和经济成本，也可能会降低医院科室的床位周转率;此外，对于急需用药的重症患者(如ICU患者)，较短的报告周期可能会起到较好的治疗作用。

运营成本：刚才也讲到，PCR的操作流程较短且操作简单，操作过程中需要最大的仪器设备就只有PCR仪，整个实验过程中也只仅需1-2个人即可，而NGS的流程则相对较长且操作复杂，操作过程中需要诸多大型仪器设备如高通量测序仪(及配套试剂)、服务器等，整个实验过程中至少需要8-10人，因此，不管是公司还是医院层面，NGS实验室的运营成本均高于PCR实验室的运营成本。

但PCR和NGS该以什么样的方式服务肿瘤基因检测呢，个人认为，未来的PCR和NGS应该是相辅相成的；使用那个平台应结合实际情况具体分析，对于大型三甲医院，因其样本量足够多，可以短时间内满足上机要求，建议以NGS+PCR的方式进行开展肿瘤基因检测，而小型医院因样本量较少，可能无法NGS上机要求，则建议以PCR为主或与第三方公司签订打包合同进行NGS检测，对于着急用药的患者或经济情况困难的患者建议选用PCR进行检测，对于想要全面查看检测结果且支付能力较强的患者建议选用NGS进行检测，对需要查找耐药机制、预后复发监控的患者则建议做NGS检测。通过根据不同情况的筛选，达到医疗最大化利用，因此，肿瘤基因检测过程中，PCR和NGS必然是相辅相成的。